学校肇始于1912年，前身为留美归国、著名医学教育家颜福庆先生创立的长沙红十字会看护训练所，1924年正式建立长沙仁术护病学校。1961年从长沙搬迁至安江建立黔阳地区卫生学校，1984年搬迁至怀化并更名为怀化地区卫生学校。2000年3月，升格为怀化医学高等专科学校。2014年5月，经教育部批准升格并更名为湖南医药学院。 
学校占地面积1418亩，校舍建筑面积26.8万㎡，现有教学科研仪器设备总值9342万元，图书馆馆藏纸质图书77万册，中外文纸质期刊578种，电子图书157万册。
学校设有医学院、药学院、护理学院、康复医学与保健学院、检验医学院、口腔医学院、医学人文与管理学院、马克思主义学院、国际教育学院、计算机科学教学研究部、体育教学研究部、继续教育学院。
学校是国家执业医师临床类别实践技能考试基地，有国家三级甲等综合性直属附属医院（临床学院）1所、非直属附属医院（临床学院）7所。其中，第一附属医院占地面积17.9万㎡，编制病床1200张，有心血管内科、呼吸内科、护理学3个省级临床重点建设专科，是国家新药临床试验机构和湖南省慢阻肺同质化培训基地。非直属附属医院包括国家三级甲等综合医院5所、国家三级甲等中医医院1所和国家三级专科医院1所，编制床位10400张。
学校校本部现有在编在岗610人，其中专任教师399人。有教授等正高职称教师53人，有副教授等副高职称教师140人，具有博士学位教师34人、硕士学位教师323人。享受政府特殊津贴专家2人，博士生导师1人，硕士生导师5人，省级教学团队1个，省级学科带头人1人，省级教学名师1人，省级青年骨干教师17人，省级优秀教师1人。
学校现有医学、管理学2个学科门类，开设临床医学、护理学等13个本科专业。有省级重点专业1个，省级特色专业2个，省级综合改革试点专业2个，国家资源共享（精品）课程1门，省级精品课程5门，省级在线开放课程2门，省级虚拟仿真实验教学中心2个。
办学95年来，学校为社会输送了近10万名医卫人才，特别是为武陵山片区培养了大批“下得去、留得住、用得好”的应用型高素质医卫人才。学校先后获得“全国卫生系统先进单位”“全国学籍管理先进单位”“全国五四红旗团委”“湖南省文明标兵单位”“湖南省就业创业示范校”“湖南省实践教学管理先进单位”等荣誉。
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