南京中医药大学翰林学院始建于2002年3月，2005年5月被教育部批准为独立学院。2010年9月，学院移址泰州市办学，为首家进驻中国医药城的全日制本科院校，也是全省高等教育综合改革试点独立学院之一。 
学院现设有中医学、针灸推拿学、护理学、康复治疗学、应用心理学、中药学、药学、生物制药、制药工程、药物制剂、中药资源与开发、药事管理、公共事业管理、国际经济与贸易、市场营销、信息管理与信息系统等18个本科专业。具有相关专业独立的学士学位授予权、高校教师资格认定权和高校教师高级职称评审权。
学院师资优良，多年来，建设了一支以母体大学南京中医药大学教师为龙头，自有专任教师为骨干，特聘教授、兼职教授为支撑的专兼结合、高素质高水平优秀师资队伍，14位国家重大人才工程项目获得者为学院的建设保驾护航。
学院致力于培养具有国际竞争能力的应用型、复合型、创新型高级人才，积极探索和创新产学研一体化办学模式，狠抓内涵建设，努力提升教学质量，优化师资队伍结构，逐步改善办学条件，不断创新管理体制机制，内部运行规范高效，形成了体现时代特征、医药特色，“校”“城”融合、注重应用能力的人才培养格局。
学院秉承南京中医药大学“治学严谨，继承创新”的优良传统，依托母体大学优质教育资源，注重质量，稳步发展，具有优良的办学条件。母体大学一大批实习实践基地及泰州国家医药高新技术产业开发区周边数百家企事业单位为学生提供良好的实践、实习、产学研结合的场所，为毕业生就业提供了广阔的前景。
学院确立了“以人为本、特色兴校、人才强校、校企合作”的办学理念，坚持以专业建设为龙头，人才培养为中心，教师队伍建设为关键，和谐校园建设为保障，不断深化教育教学改革，着力提升学院的核心竞争力。在武书连2019中国独立学院排行榜中，学院入选“中国高水平独立学院”，全国排名第13，省内排名第4。全院师生将凝心聚力，励精图治，努力把学院建设成为办学规模、专业设置、人才培养质量适应区域经济和泰州中国医药城产业发展的新型独立学院。
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